Un estudio liderado por la Universidad Complutense de Madrid (UCM) -en el marco del programa de ciencia ciudadana MicroMundo- ha obtenido extractos de bacterias del suelo con capacidad inhibitoria frente a bacterias patógenas del grupo ESKAPE, causantes de infecciones graves y que presentan resistencia múltiple a antibióticos.
El aumento de la resistencia a los antimicrobianos, junto con la ralentización del descubrimiento de nuevos fármacos, representa una grave amenaza para la salud pública. La Organización Mundial de la Salud considera prioritario combatir a las bacterias patógenas del grupo ESKAPE (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Enterobacter spp.), que destacan por su capacidad para desarrollar y acumular resistencias a los antibióticos, lo que dificulta el tratamiento de las infecciones que causan. Estas bacterias son causantes de decenas de miles de muertes anulamente en los hospitales de toda Europa y más de un millón a nivel global
“Para abordar esta necesidad, la bioprospección en suelos permite identificar microorganismos que, al competir por los recursos, producen sustancias capaces de inhibir el crecimiento de otros microorganismos y que podrían servir como base para desarrollar nuevos antibióticos”, destaca Julio Jesús Estrada Valbuena, investigador del Departamento de Microbiología y Parasitología de la UCM.
Proyecto MicroMundo
En el proyecto MicroMundo, estudiantes de enseñanza secundaria, bachillerato y grado universitario recolectaron entre 2017 y 2019 un total de 478 muestras de suelo en diversos puntos de la Comunidad de Madrid. A partir de estas muestras, los investigadores de la UCM aislaron 6.403 colonias bacterianas, que se evaluaron inicialmente para determinar su capacidad de inhibir el crecimiento de dos cepas bacterianas inocuas utilizadas como modelo (Kocuria rhizophila y Escherichia coli).
De los aislados analizados, el estudio publicado en Medicine Bulletin señala que 261 (un 4,1 %) mostraron capacidad de inhibición frente a al menos una de las cepas diana. De estos, se seleccionaron los 45 aislados que mostraron mayor capacidad de inhibir el crecimiento de las cepas diana para su conservación y posterior caracterización en los laboratorios universitarios.
“Al evaluar los 45 candidatos frente a un panel de patógenos de relevancia clínica (incluyendo miembros del grupo ESKAPE), el 58 % mantuvieron su capacidad de antibiosis. Staphylococcus aureus fue el patógeno más sensible, mientras que las bacterias Gram-negativas mostraron una susceptibilidad más reducida”, indica el investigador de la UCM.
Tras evaluar su actividad frente al panel de patógenos, se seleccionaron los aislados que inhibieron el crecimiento de un mayor número de especies y mostraron una mayor capacidad de inhibición para su identificación molecular mediante la amplificación y secuenciación del gen del ARN ribosómico 16S. Se identificaron las especies Bacillus pumilus, Paenibacillus peoriae y Bacillus cereus.
Actividad bactericida
A partir de los aislados más prometedores, se obtuvieron extractos orgánicos crudos, que mantuvieron la capacidad de inhibir el crecimiento microbiano tanto en cultivos sólidos en placa Petri como en medio líquido. Los ensayos de concentración mínima inhibitoria (MIC) y concentración mínima bactericida (MBC) mostraron que los extractos presentan actividad bactericida frente a las bacterias evaluadas.
“Los programas de ciencia ciudadana y aprendizaje-servicio, como el proyecto MicroMundo, han demostrado ser herramientas fundamentales para escalar el muestreo ambiental mientras se fomenta la concienciación social sobre las resistencias bacterianas”, concluye Estrada.
Víctor J. Cid, Catedrático de Microbiología en la Facultad de Farmacia UCM, el investigador que introdujo MicroMundo en España y también autor del estudio, añade: “La diversidad química de la microbiota de los suelos guarda aún muchos secretos. Estoy seguro de que aún podemos encontrar muchas bioactividades interesantes. Después de diez años de trabajo, MicroMundo se ha convertido en una referencia como proyecto de aprendizaje-servicio y ciencia ciudadana desde la perspectiva One Health, pero estamos solo comenzando a sacar rendimiento a esta iniciativa en cuanto a su potencial para el descubrimiento de nuevos fármacos.”
Referencia bibliográfica:
Estrada-Valbuena, J.J., Vico-Uribes, C., Fernández-Vega, A., Cid, V.J., Parra-Giraldo, C.M., Martínez-López, R. (2026). «Bioprospecting Soil Microorganisms as a Source of Antimicrobial Compounds Active Against ESKAPE Pathogens.» Medicine Bulletin, e70054. DOI: 10.1002/mdb2.70054.
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